在探讨“软件定制开发税率是6还是13”的问题时，我们首先要明确的是，这里的税率实际上是指增值税（VAT）的税率。根据中国的税法规定，不同类型的业务和商品适用不同的税率。

一、了解软件服务的增值税政策

对于软件定制开发而言，其属于信息技术服务业的一部分，按照现行的增值税条例，一般纳税人的软件开发服务适用的增值税率为6%。这主要是因为这类服务通常被视为“咨询服务”，根据国家税务总局的相关规定，其适用税率为6%。

二、区分不同类型的纳税人

• 一般纳税人：

  对于年销售额超过500万元的企业，可以选择成为增值税一般纳税人，并适用6%的税率。这样可以合法地抵扣进项税额。

• 小规模纳税人：

  如果企业选择或未达到成为一般纳税人的标准，则需按照小规模纳税人的身份申报，其征收率为3%，但在实际操作中可能会采取简易办法计算，即按6%的税率减去3%后的3%来计税。

三、特殊业务类型的税率

• 增值电信服务：

  虽然这不直接与软件开发相关，但了解这一点有助于全面理解中国增值税的分类。对于增值电信服务，其适用税率为6%。

• 信息技术服务业：

  除了软件开发外，其他如信息系统集成、IT外包等信息技术服务同样适用6%的税率。

综上所述，对于软件定制开发来说，其增值税率通常是6%，这取决于企业是否为一般纳税人以及具体的业务类型。而13%的税率通常适用于销售货物和服务，例如机械设备和建筑材料等商品。

因此，在进行软件定制开发项目时，企业需要根据自身情况选择合适的税务身份，并确保遵守最新的税法规定，以避免不必要的法律风险。